石英砂做为鱼缸底砂是水草根部支撑的基础，底砂大小的选择的是否适当，直接影响着水草根系的发育与成长，甚至也可能成为水草栽培成功与否的重要因素，同时也影响的水质，因此必须引起重视。理想的鱼缸底砂选择必须根据其物理、化学及生物特性来挑选。有锋利锐边的砂不能使用，因为锋口会造成有挖掘习性的鱼类，如鼠鱼会受到伤害；过于磨光圆滑的石英砂也不宜使用，十分光滑的砂粒，其表面积明显变小，使有益细菌的生存环境受到限制，生物过滤的效能会随之降低。
　　底砂的大小：
　　用做水族箱底砂的石英砂大小必须适当，过于细小或者过于粗大都不合适。如果使用太细小的砂粒作底砂，可能会像土壤一般，很容易引起水质浑浊及通气性不佳的问题。反之，若使用过于粗大的砂粒，水草扎根会有困难，也不利于水草的生长。一般以粒径介于2-4 mm为佳。
　　最好以两种不同粗细的砂搭配使用，例如下层用3-5毫米的粗砂，粗砂通气性好，有利嗜氧细菌生长，上层用2毫米左右的细砂有利水草的栽植，特别是小型水草的固定。
　　底砂的厚度：
　　鱼缸底砂的厚度取决于两个因素：首先应能将植物固定，特别是那些株形和叶形都大的水草需要种植到足够深度才不致浮起，块茎类水草的块茎要能够充分埋入;其次是作为过滤层供给有益细菌附着的面积足够大，以满足生物过滤的需要。
　　这两个因素中将植物固定所需的厚度较容易掌握，而给予有益细菌提供作够的附着场所则较难以衡量，一般认为底砂的厚度应达到5cm左右，才能同时满足上述两个条件。
　　然后具体的情况就要根据鱼缸的用途来确定了，比如养虾的底砂可以薄一点，大约3cm左右即可，养水草就要厚点5-6cm左右。
　　当然还要根据鱼缸的大小来确定鱼缸底砂的厚度，小型鱼缸〈75cm以下〉，其前景总高约5cm左右，後景底砂高度亦不宜超过鱼缸高度之1/4;大型鱼缸〈90cm以上〉，依鱼缸之高度，所栽植之水草的种类及造景所需而有所调整，前景总高约8-10cm左右，而後景如栽植大型水草，其根部之延伸宽且深，其底砂厚度就需要厚一点，通常约15~25cm左右(其厚度主要依照造景所需而定)。
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